Senior bioinformatiker till GMCK

Vill du arbeta i absolut framkant av den molekylära precisionsdiagnostiken? Vi söker bioinformatiker för att stärka den pågående implementeringen av storskalig DNA-sekvensering inom sjukvården. 

• En spännande multidisciplinär arbetsmiljö där ditt dagliga arbete gör stor skillnad för ett stort antal patienter
• Stor möjlighet att utvecklas i din roll och ta dig an nya arbetsuppgifter över tid
• Möjligheten att arbeta på ett av världens bästa sjukhus med vård i framkant ( - Newsweek Rankings).

Självklart får du också ta del av som Karolinska Universitetssjukhuset erbjuder dig.

Tjänsten är placerad vid Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK), som är en del av Medicinsk diagnostik Karolinska (MDK). GMCK ansvarar för att tillhandahålla storskaliga och avancerade genomikanalyser till samtliga laboratoriemedicinska specialiteter inom MDK. Vårt uppdrag är att möjliggöra precisionsdiagnostik genom högkvalitativa genetiska analyser med fokus på klinisk relevans och teknisk spetskompetens.

Du bidrar till arbetet i ett multidisciplinärt team tillsammans med läkare, molekylärbiologer, andra bioinformatiker och mjukvaruutvecklare inom sjukhuset samt med forskningsinfrastrukturen Clinical Genomics vid Science for Life laboratoriet (SciLifeLab) och forskargrupper på Karolinska Institutet. 

I rollen kommer du bland annat att:

• bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av våra bioinformatiska NGS flöden
• analysera patientprover inom interna och externa forskningsprojekt och kliniska implementationsprojekt.
• bidra med expertis inom dataanalys i bioinformatiska utvecklingsprojekt.
• bistå vår våtlabbsenhet med expertis inom dataanalys vid implementering av nya tekniker och metoder.
• delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande arbetsflöde.
• delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten, exempelvis inom Genomic Medicine Sweden (GMS).

• är noggrann, strukturerad och har hög ansvarskänsla för kliniska leveranser.
• har en stark analytisk förmåga och nyfikenhet på nya tekniker inom genomik.
• har en god kommunikativ förmåga och trivs i gränssnittet mellan bioinformatik och medicinsk diagnostik.
• har ett engagemang för kvalitet och trivs med att samverka i grupp.

Krav:

• Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant område.
• Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS).
• Goda programmeringskunskaper (t.ex. Python, R)
• Vana att arbeta i Linuxmiljö
• Erfarenhet av arbete i HPC-miljö, gärna med SLURM
• Goda kunskaper inom statistik, analys och testdesign
• Mycket god förmåga att uttrycka dig på engelska, både muntligt och skriftligt

Meriterande:

• Doktorsexamen (PhD) inom relevant område.
• Erfarenhet av arbete i klinisk sjukhusmiljö, nära genetik eller patologi, eller inom annan ackrediterad verksamhet (t.ex. ISO 15189).
• Erfarenhet av containerteknologier (t.ex. Singularity, Docker)
• Erfarenhet av automatiserad testning, CI och strukturerad kod
• Kunskap i versionshantering (Git)
• Erfarenhet inom utveckling av bioinformatiska analyser med Nextflow eller liknande ramverk för automatisering av beräkningsanalyser
• Erfarenhet av utveckling och arbete i kvalitetssäkrade miljöer
• God förståelse för human genomik kopplat till sällsynta diagnoser eller somatiska sjukdomar 
• Fördjupade kunskaper inom design och validering av breda genetiska paneler.
• Goda kunskaper i svenska i tal och skrift.

Om rekryteringsprocessen

Urval och intervjuer kan komma att ske löpande under ansökningstiden.

I samband med din ansökan behöver du bifoga CV. Istället för ett personligt brev ber vi dig besvara urvalsfrågor samt kort motivera varför du passar för rollen. Att besvara frågorna är en förutsättning för att din ansökan ska anses komplett.

Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska!

Inför tillsättning av befattning som innefattar vård av barn och ungdom, kontrolleras den som erbjuds tjänsten mot misstanke- och belastningsregistret.

Som anställd på Karolinska Universitetssjukhuset kan du komma att krigsplaceras.

Om du är eller tidigare har varit anställd i Region Stockholm kommer vi att ta interna referenser från din nuvarande eller tidigare chef om du blir aktuell för anställning.

För tillsvidaretjänster kan provanställning komma att tillämpas.

Om Karolinska Universitetssjukhuset
Vi på Karolinska Universitetssjukhuset är stolta över att vi är ett av världens främsta universitetssjukhus. Förutom vårt särskilda ansvar för den högspecialiserade vården i Stockholmsregionen är huvuduppdraget att tillsammans med Karolinska Institutet utbilda framtidens vårdanställda och bedriva världsledande forskning samtidigt som vi fortsätter vårt arbete med att utveckla vården för patientens bästa. Vi arbetar inom en rad olika områden och professioner.



Vår vision - Vi ska bota och lindra imorgon det ingen kan bota och lindra idag.

Läs gärna mer om oss på och följ oss på sociala medier!

Funktion Medicinsk Diagnostik Karolinska
Funktion Medicinsk Diagnostik Karolinska är en sammanslagning av Karolinska Universitetslaboratoriet och Bild och Funktion med laboratorieverksamhet, radiologi, nuklearmedicin, medicinsk strålningsfysik, radiofarmaci och strålsäkerhet inom Karolinska Universitetssjukhuset.

Att söka jobb i Region Stockholm

Vi eftersträvar jämställdhet och jämlikhet på vår arbetsplats och ser gärna sökande med olika bakgrund och förutsättningar.

Vi tar endast emot ansökningar via detta system. Ansök genom att klicka på knappen ”Ansök”. Ansökningar per brev eller e-post beaktas inte. Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt säljare av ytterligare jobbannonser.

Vårt rekryteringssystem kan inte hantera anonyma ansökningar eller sökande med skyddade personuppgifter. Om du har skyddade personuppgifter ber vi dig att kontakta den kontaktpersonen som finns angiven i annonsen. Din ansökan kommer då att hanteras utanför rekryteringssystemet. Du bör även vara försiktig med vilken information du lämnar i din ansökan och endast ta med information som är relevant för den aktuella befattningen.

Region Stockholm ansvarar för hälso- och sjukvård, kollektivtrafik, regional utveckling och bidrar till kulturlivet. Varje dag, dygnet runt. I landets snabbaste växande region. Tillsammans skapar vi Europas attraktivaste storstadsregion.

Karolinska Universitetssjukhuset är ett av Europas största universitetssjukhus. Tillsammans med Karolinska Institutet utgör sjukhuset ett medicinskt centrum med högt internationellt anseende. Hos oss är patienten alltid i fokus. Vi ger kvalitativ och säker vård, med bästa expertis, behandlingsmetoder och omvårdnad ser vi till att våra patienter får ett personligt bemötande och vi omsätter forskning, utbildning och utveckling till vården.